Nexus 3にアップグレードする前に、ソースバージョンを利用可能な最新のNexus 2.xバージョン(詳細はNexus 2.xから利用可能な最新のNexus 2.xバージョンにアップグレード)にアップグレードします。Talendではまた、たとえばJavaランタイム環境への変更など、バージョン2.xとバージョン3の間のデプロイに影響を与える可能性のあるプラットフォーム互換性の変更がないかチェックすることをお勧めします。
詳細は、Sonatypeのドキュメンテーション: https://help.sonatype.com/repomanager3/upgradingをご覧ください。